Setelah istirahat beberapa tahun, Eliza muncul sebagai Faith yang cantik dan licik dalam serial Warner Bros. Buffy the Vampire Slayer yang dibintangi oleh Sarah Michelle Gellar yang juga cantik dan seksi. Perannya awalnya ditulis untuk lima episode, tetapi ia bertahan di seluruh musim ketiga dan mengulangi perannya dalam episode dua bagian di musim keempat. Faith kembali sebagai pahlawan wanita di Angel bersama Brian Boreanaz. Sebagai aktris yang hebat dalam peran sosiopat, ia menjadi simbol bagi beberapa penjahat.
Kesuksesannya yang luar biasa di televisi membuatnya mudah untuk beralih ke dunia film. Film comeback-nya, Provide It On, bersama Kirsten Dunst, menjadi kejutan besar pada tahun 2000. Tahun berikutnya, ia membintangi The New Person bersama DJ Qualls dan film kolaborasinya dengan nonton samehadaku De Niro dalam Town By the Sea. Kemudian ia membintangi film Kevin Smith, Jay and Silent Bob, bersama Bill Affleck, serta bintang-bintang populer Shannon Elizabeth dan Ali Larter. Film selanjutnya, Incorrect Change, menempatkannya sebagai pemeran utama dalam kisah lima orang yang menjadi mangsa sekelompok kecil kanibal.
Pada tahun 2003, ia membintangi serial TV FOX, Tru Calling, di mana ia memerankan karakter utama Tru Davies. Serial ini bertahan selama 27 episode sebelum jaringan tersebut menghentikan penayangannya. Ia memulai debutnya di Broadway melalui Pet Thoughts God yang diadaptasi dari komik Nuts. Suaranya diisi dalam gim video PlayStation 2 Yakuza dan muncul dalam film Simple Plan, I'm Michael Merely a Kid.
Serius, saya jatuh cinta dengan tangan Michelle Obama selama pemilihan presiden tahun 2008. Dan begitu Ibu Negara berusia 45 tahun itu tampil di sampul majalah Style edisi Maret 2009 (difoto dengan indah oleh fotografer terkenal Annie Leibovitz), saya menyadari bahwa saya ingin memiliki tangan yang berkilau, ramping, dan berotot seperti miliknya.